LTQ XL擁有的靈敏度和超快的周期時間，可以保證在最短的時間內用最少的樣品得到最多的質譜信息。LTQ XL提供的高質量的譜圖和數據分析軟件包聯合可以為復雜結構確證研究提供完整的解決方案。Thermo Scientific LTQ XL質譜與Ultimate 3000高速液相色譜系統聯用，是高通量分析的工具。結合多種解離技術，包括脈沖碰撞解離(PQD）和電子轉移解離(ETD），LTQ XL提供的結構信息。廣泛應用于蛋白質組學、代謝物鑒定、藥物研發定量分析、法醫和臨床分析等領域。
- 可升級的電子轉移裂解（ETD)模塊可以提供傳統裂解方法無法得到的蛋白質翻譯后修飾信息;
- 脈沖碰撞能量誘導解離（PQD)功能可以提供低質量端碎片離子信息;
- 高選擇MS/MS分析給譜圖在數據庫和譜庫檢索更好的匹配，提高了結構確證的可靠性;
- 快速極性切換，母離子相關MS3數據關聯掃描，可以對翻譯后修飾和代謝物組成的鑒定進行智能、快速分析;
- 可以和的回旋共振質譜組合成的多級高分辨雜交質譜儀;
- 自動數據依賴性多級質譜采集技術不僅為用戶提供預測代謝物（母離子列表）結構信息，也能提供未預測到的代謝物結構信息;
- 此外使用自動固定中性丟失數據依賴性(CNL)掃描觸發三級質譜掃描能檢測某一類的代謝物;
- 使用MetworksTM 和Mass Frontier分析軟件增強復雜基質中代謝物篩選和鑒別功能，使譜圖解析更簡便;
- 滿足各種需要的離子源配置：ESI(電噴霧電離源），APCI(大氣壓化學電離源），APPI（大氣壓光電離源），納噴電離源（NSI)。
- 應對代謝物鑒定和確證，LTQ系列質譜可自動查找到所有可能的代謝物。
- 基于離子/離子化學的電子轉移解離(ETD)，LTQ XL離子阱是實現此技術的儀器。ETD與CID互為補充，提高蛋白序列覆蓋率；保護不穩定PTM翻譯后修飾基團，簡化數據分析；單次進樣自動啟動CID和ETD。
- 母離子智能選擇：自動數據依賴多級質譜采集技術不僅能為用戶提供預測代謝物（母離子列表）結構信息，也能提供提供未預測的代謝物結構信息。此外，使用自動固定中性丟失數據依賴性（CNL)掃描觸發三級質譜掃描能檢測某一類的代謝物。使用MetWorks和MassFrontier分析軟件增強復雜基質鐘代謝物篩選和鑒別功能，使譜圖解析更加簡便。
- 應對蛋白質組學和生物標記問題，ETD解離技術使LTQ XL成為蛋白質組學研究更強大的分析工具。
- LTQ和LTQ XL質譜均可配置ETD裂解源，ETD能夠為線性離子阱提供類似ECD（電子捕獲解離）的裂解碎片，在生成大量肽段碎片的同時，保護不穩定的PTM翻譯后修飾集團，例如磷酸化翻譯后修飾。ETD功能與賽默飛世爾線性離子阱的高離子儲存量相結合，是蛋白質和肽類分析的新型有效工具。
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