Oncomine™ Lung cfDNA 檢測是檢測 cfDNA 中肺癌腫瘤來源 DNA (ctDNA) 的完整研究解決方案的一部分。其提供了文庫構建試劑，以及用于從一管全血的血漿組分中獲得的無細胞 DNA (cfDNA) 中制備擴增子文庫的一池多重 PCR 引物。該檢測可幫助研究人員分析非小細胞肺癌 (NSCLC) 經常突變的單核苷酸變體和短插入缺失。覆蓋 11 個基因和 >150 個熱點（基因：ALK、BRAF、EGFR、ERBB2、KRAS、MAP2K1、MET、NRAS、PIK3CA、ROS1 和 TP53）。通過使用專有測序技術，可實現低至 0.1% 的檢測限 (LOD)。

注：可在下文‘文件’中找到使用 Torrent Suite 軟件 5.2 進行 cfDNA 變體分析的靶標和熱點 BED 文檔和用戶指導文件。

•用于短 cfDNA (～170 bp) 的優化擴增子設計
• 檢測單核苷酸變異 (SNV) 和低至 0.1% LOD 的短插入缺失
• 優化的靶向測定試劑盒設計可進行高度多重下一代測序 (NGS)，降低測序成本
• 非常高的靈敏度和特異性，可使用較小假陽性進行極低水平檢測
• 高效工作流程，從一管血液到得出結果僅需 2 天

為什么病理科醫生和腫瘤科醫生關注液體活檢臨床癌癥研究？液體活檢相比于傳統實體腫瘤樣本檢測的優勢：
• 微創獲取，可多次采集腫瘤內容物樣品
• 與傳統組織采樣相比成本更低
• 從采樣至得到結果的周轉時間更短
• 有助于捕獲更多腫瘤的異質性
• 可改善未來標準診療

使用 Ion Chef™ 系統和 Ion S5™ XL 測序系統可僅在 2 天內完成從使用 MagMAX™ 無細胞 DNA 分離試劑盒進行 cfDNA 分離到樣品分析的整個工作流程（下圖）。

與具有低 LOD (1-5%) 的其他技術不同，Oncomine 肺 cfDNA 測定試劑盒具有低至 0.1% 的靈活檢測限或在 1,000 個野生型拷貝背景中具有 1 個突變體拷貝。為了達到 0.1% LOD，需要 20 ng cfDNA 上樣量。cfDNA 用量可以更低，但 LOD 將更高，這取決于上樣量。

簡單性、速度和可擴展性
Oncomine 肺 cfDNA 測定試劑盒只需 1 ng cfDNA 上樣量即可進行靶向文庫構建從而進行癌癥基因研究。cfDNA 檢測試劑盒使用標準 PCR 設備和 2 次簡單的 PCR 反應，一次用于測序，另一次用于擴增文庫以進行高度多重 PCR 靶標的選擇，這將減少擴大資本投資的需求。此外，Oncomine Lung cfDNA 檢測試劑盒與 FFPE 樣品兼容，可用于潛在的一致性研究。靶向文庫的總時間通常僅為 3.5 小時。使用標簽測序條形碼套件 1-24 實現可擴展性和靈活性