玻璃分子蒸餾利用液體混合物中各組分揮發度的差別，使液體混合物部分汽化并隨之使蒸氣部分冷凝，從而實現其所含組分的分離。是一種屬于傳質分離的單元操作。
分子蒸餾不同于一般的蒸餾技術。它是運用不同物質分子運動平均自由程的差別而實現物質的分離,因而能夠實現在遠離沸點下操作。
根據分子運動理論,液體混合物的分子受熱后運動會加劇,當接受到足夠能量時,就會從液面逸出而成為氣相分子,隨著液面上方氣相分子的增加,有一部分氣體就會返回液體,在外界條件保持恒定情況下,就會達到分子運動的動態平衡。從宏觀上看達到了平衡。
玻璃分子蒸餾是利用混合物不同類型分子平均自由程的差異，在高溫、高真空的情況下把這種差異放大，平均自由程大的分子運動到主蒸發器中心的冷凝凝結成液態進入我們專門的輕組分收集瓶中，一部分平均自由程小的分子在高溫下仍然以液態的形式在主蒸發器壁留下然后由于重力流到重組分收集瓶中。搭配不同的冷阱冷卻未被冷凝收集的蒸汽，可以得到不同的物料。
玻璃分子蒸餾設備主要特點:
1、內置冷凝器與主蒸發器為一體設計，一體生產，減少安裝難度，減少了連接接口，增加了真空密封性，減少因接口密封漏氣可能性；
2、連接接口密封采用自行設計的四氟O型圈線性密封，采用馬蹄型夾緊固。方便安裝、拆卸。
3、設備在一級泵情況下可到0.1mbar以下，在選用二級泵可達0.001mbar的高真空度。
3、采用自行設計磁力傳動密封，攪拌轉子的轉軸與電機分離，電機和轉子通過磁力耦合傳動，保證了高度密封性，內部軸承采用進口耐熱耐腐蝕耐磨軸承，保證其高速旋轉的使用壽命，
4、采用刮板式成膜，使其成膜更薄，為使刮板更貼蒸發器內壁，每根刮板與骨架之間均有彈簧做緩沖。
5、物料從進料到出料，全程可觀看蒸餾、分離概況，可根據蒸餾情況調整各部件的參數或前置工藝。
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