全自動微孔過濾機使用前必須檢查配件和密封圈是否齊全，有無損壞，然后按要求把它裝好。新的過濾器必須用清潔劑清洗干凈洗凈后用高溫蒸汽殺菌、消毒、洗凈的濾器要放好，避免污染。在微孔過濾機的安裝時進出口不要接反，管道濾器底板邊上的口是液體進口處，管道接在濾芯插口的管子是干凈液體出口處。新的濾芯是生產廠家在潔凈的生產廠房內用塑料袋封裝的未使用切勿撕破塑料包裝，使用要求較高的濾芯，安裝好后要經過高溫蒸汽殺菌消毒。
1、全自動微孔過濾機的過濾操作
打開排氣閥門，并徐徐打開進料閥門，引入待濾料液，當排氣閥門有料液流出時，立即關閉排氣閥們，并徐徐開啟出料閥門。
在過濾初期，由于濾芯還很干凈，過濾速度也很快，所以過濾器內壓一般維持在0.05-0.1mpa即可。隨著時間的推移，為了維持適當的過濾率，可逐步調高器內壓力，但過濾器內的大壓力均不能超過不同材質濾芯所允許的大操作壓力。
當內壓力已經較高，而過濾速度又減慢得較多時，就應停上過濾操作，并對過濾器進行清晰了。
2、全自動微孔過濾機濾芯的反沖洗
①對于礦泉水以及水處理中的精濾，反沖時可選用清洗進行反沖，再用終端過濾的潔凈水反沖后，即可再投入生產。
②對于啤酒、飲料等發酵料液和含糖料液的過濾，建議先采用經過預處理的潔凈無油壓縮空氣反吹，然后再清水發沖，再用經終端過濾的潔凈水反沖干凈后，即可再投入生產。
③濾芯適應時間已經較長，用上述方法反沖后，其過濾速度仍然復不得夠理想時，即可將濾芯卸下，放入濃度為2-4%的NaOH溶液浸泡4-8小時，在用經終端過濾的潔凈水沖洗至無殘留。清水沖洗至無殘留清潔劑，然后進行安裝。
④安裝完畢后，應用蒸汽對過濾系統進行一次全面消毒，所用蒸汽壓力不得高于0.15mpa，消毒時間20分鐘。消毒后還要全面檢查系統內所有緊固螺栓有否松脫，并予以重新緊固。
⑤用蒸汽消毒前，必須先將蒸汽管道的汽凝水排盡，若全自動微孔過濾機內有濾氣體必須先進行除濕；如果是過濾壓縮空氣，還應該先將壓縮空氣脫油，然后才能進行過濾。
一般來講，全自動微孔過濾機在操作一段時間后壓力會逐漸升高。當壓差到達0.015mpa時，就應該停止操作，待清洗完畢后，再安裝好繼續進行操作。
