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標準的PCR實驗室如何建立?

來源:泰思楓(上海)環??萍加邢薰?/a>   2024年04月01日 16:33  
  齊全的實驗室配套設施是保證實驗工作的必要條件。根據各實驗室不同的實驗內容,配備相應的設備和儀器,如超凈工作臺、離心機、進樣器等。
 
  PCR實驗室是分子診斷的基礎,也是PCR實驗的重要場所。它可以通過擴增病毒所含的基因來檢測一些病毒含量較低的感染者是否含有特定病毒。近年來,分子診斷行業發展迅速,已廣泛應用于醫院臨床診斷、病原菌檢測、各防疫檢測部門禽病診斷等。但這種實驗需要一個能保證絕對安全、配置合理、操作非常規范的實驗室。
 
  今天的文章將從臨床基因擴增檢測實驗室的樓層布局、空調通風系統設計、氣流控制和污染防治等方面來闡述實驗室設計的主要特點。
 
  

 


 
  一、PCR實驗室平面布局
 
  PCR實驗室原則上分為四個獨立的工作區域:試劑儲存和準備區、標本制備區、擴增反應混合物制備以及擴增區和擴增產物分析區。為避免交叉污染,進入各工作區域必須嚴格從一個方向進入,即只能從試劑儲存和制備區→標本制備區→擴增反應混合物制備和擴增區→擴增產物分析區進入。
 
  實驗區域之間試劑和樣品的傳遞應通過傳遞窗進行。
 
  二、實驗室空調通風系統設計及壓力控制
 
  PCR實驗室沒有嚴格的凈化要求,但為了避免各實驗區域之間交叉污染的可能性,建議采用全送風、全排風的氣流組織。同時,必須嚴格控制送風和排風的比例,保證各實驗區的壓力要求。
 
  
  1.試劑貯存和準備區
 
  本實驗區的主要操作是儲存試劑的制備、試劑的包裝和主反應混合物的制備。標本制備所用的試劑和材料應直接運輸至該區域,不得途經其他區域。該區域必須存放試劑原料,并在此區域準備所需的儲存試劑。
 
  該區對氣流壓力的控制沒有嚴格要求。
 
 
  2.標本制備區
 
  該領域的主要操作是臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)的提取和儲存,以及將其添加到擴增反應管中并測量RNA時合成cDNA。 。
 
  該區域的壓力梯度要求為:相對鄰近區域為正壓,避免氣溶膠污染從鄰近區域進入該區域。此外,由于操作過程中可能會發生氣溶膠污染,因此應避免在該區域進行不必要的移動。
 
 
  3.擴增反應混合物配制和擴增區
 
  該區域的主要操作是DNA或cDNA擴增。此外,準備好的DNA模板和合成的cDNA(來自樣品制備區域)的添加以及主反應混合物(來自試劑儲存和制備區域)到反應混合物中的制備也可以在該區域中進行。在巢式 PCR 檢測中,通常必須在第一輪擴增后打開反應管。因此,嵌套擴增污染風險較高,第二次加樣必須在此區域進行。
 
  該區域的壓力梯度要求為:相對鄰近區域為負壓,以防止氣溶膠從該區域泄漏。為避免氣溶膠造成污染,應盡量減少該區域不必要的活動。添加樣品等單獨操作應在超凈工作臺中進行。
 
 
  4.擴增產物分析區
 
  該區域的主要操作是擴增片段的測量。若采用全自動密閉分析儀器檢測,則無需設置該區域。
 
  該區域是擴增產物的主要污染源,因此該區域的壓力梯度要求為:相對鄰近區域為負壓,以防止擴增產物從該區域擴散到其他區域
 
  三、污染的預防與控制
 
  PCR實驗室設計的核心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的污染類型有: 擴增產物的污染;天然基因組 DNA 的污染;試劑污染和標本之間的污染。一旦發生污染,必須停止實驗,直至找到污染源,實驗結果必須作廢,并重新進行實驗。因此,污染發生后,在實驗室尋找污染源不僅費時、繁瑣,而且浪費人力、物力。因此,要避免污染,首先要預防,而不是消除。
 

 
  1.工作區域的嚴格劃分
 
  (1)合理設置各實驗區。
 
  (2)每個實驗區域必須有明顯的標識(如醒目的門號或不同的地板顏色等),避免不同實驗區域的設備、物品、試劑等混淆。
 
 
  2.合理的系統設置
 
  (1)合理的空調、通風系統設置,盡量采用送排風充分的空調系統。
 
  (2)嚴格的氣流壓力控制,保證不同實驗區域不同的壓力要求。
 
 
  3.規范的操作
 
  (1)臨床基因擴增檢測實驗室技術人員必須經過崗位培訓。通過培訓后才能從事臨床基因擴增檢測。
 
  (2)實驗操作過程中,操作人員必須戴手套并經常更換。此外,操作時使用一次性瓶蓋也是防止污染的有效措施。
 
  (3)清潔工作及時、正確。實驗工作完成后,必須立即清理該區域。一些實驗器具除了用常規消毒液擦拭表面或用紫外線消毒外,還應采用高壓消毒。
 
 
  4.嚴格的管理
 
  (1)嚴格控制人員進出實驗室。與實驗無關的人員不得隨意進出實驗室。如有可能,整個實驗區必須設置獨立的通道和門
 
  (2)各實驗區域使用有明顯區分標志(如不同顏色)的工作服,工作人員離開時,不得將該區域的工作服帶到其他區域。
 
  (3) 盡量減少實驗區內不必要的活動,減少交叉污染的可能性
 
  (4)擴增產物分析區是擴增產物污染的主要來源,廢液不能傾倒在實驗室內,必須用消毒液浸泡消毒后棄出實驗室。用過的移液器吸頭和其他一次性材料也應該用消毒劑浸泡消毒,然后統一處理,例如焚燒
 
  (5)擴增產物分析實驗室中可能會使用某些致突變、有毒物質,因此應特別注意實驗人員的安全。
 

 
  5.完備的實驗室配套設施
 
  齊全的實驗室配套設施是保證實驗工作的必要條件。根據各實驗室不同的實驗內容,配備相應的設備和儀器,如超凈工作臺、離心機、進樣器等。

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